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生物化學(xué)總結(jié)酶
總結(jié)是指社會團(tuán)體、企業(yè)單位和個人在自身的某一時期、某一項(xiàng)目或某些工作告一段落或者全部完成后進(jìn)行回顧檢查、分析評價,從而肯定成績,得到經(jīng)驗(yàn),找出差距,得出教訓(xùn)和一些規(guī)律性認(rèn)識的一種書面材料,他能夠提升我們的書面表達(dá)能力,讓我們一起來學(xué)習(xí)寫總結(jié)吧?偨Y(jié)怎么寫才能發(fā)揮它的作用呢?以下是小編為大家整理的生物化學(xué)總結(jié)酶,歡迎閱讀與收藏。
酶的概論
1.定義:具有高效性與特異性的生物催化劑。
2.酶作為生物催化劑的特點(diǎn):
a.酶具有很高的催化效率。
b.酶具有高度專一性。
c.酶易失活。
d.酶活性受到調(diào)節(jié)和控制。
3.酶作用專一性的機(jī)制與假說:鎖鑰學(xué)說、誘導(dǎo)契合學(xué)說。
4.酶的化學(xué)組成:
5.酶的命名:反應(yīng)物:反應(yīng)物+反應(yīng)類型+酶。
6.六大酶類:
酶的催化原理
1.酶通過降低反應(yīng)的活化能,從而使反應(yīng)速率增大。
2.酶與底物復(fù)合物的形成:
3.酶的活性部位:蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)決定功能,酶活性部位的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)決定酶行使其催化功能的特點(diǎn)(高效性、專一性);钚圆课皇敲附Y(jié)合和催化底物反應(yīng)的場所,是酶分子表面的一小部分區(qū)域,其功能基團(tuán)包含催化基團(tuán)與結(jié)合基團(tuán)。
特點(diǎn):
a.活性部位在酶分子整個體積中只占很小的一部分。
b.酶的活性部位具有三維立體結(jié)構(gòu)。
c.酶的活性部位是酶分子上的一個裂隙。
d.活性部位具有與底物相對互補(bǔ)的結(jié)構(gòu),酶活性部位具有柔性,可發(fā)生誘導(dǎo)契合。
e.底物通過非共價作用結(jié)合到酶分子上。
f.活性部位對酶的整體構(gòu)象具有依賴性。
4.影響酶催化效率的因素:(改變反應(yīng)途徑降低活化能)
非共價作用:鄰近效應(yīng)與定向效應(yīng)、底物的形變與誘導(dǎo)契合(←過渡態(tài)理論)。
共價作用:酸堿催化、共價催化、金屬離子催化。
(1).鄰近效應(yīng):酶與底物結(jié)合以后,使原來游離的底物集中于酶的活性部位,從而減小底物之間或底物與酶的催化基團(tuán)之間的距離,提高底物有效濃度,使反應(yīng)更容易進(jìn)行,增加反應(yīng)速率的一種效應(yīng)。定向效應(yīng):反應(yīng)物的反應(yīng)基團(tuán)之間、以及酶的催化基團(tuán)與底物的反應(yīng)基團(tuán)之間的正確定位和取向產(chǎn)生的效應(yīng)。
(2).當(dāng)酶與底物結(jié)合后,酶與底物之間的非共價作用可以使底物分子圍繞其敏感鍵發(fā)生形變,從而促進(jìn)底物過渡態(tài)的形成,反應(yīng)活化能被降低,反應(yīng)速率得以加快。酶與底物結(jié)合時,在底物發(fā)生形變的同時,酶活性部位的構(gòu)象也在底物的影響作用下發(fā)生改變,二者的形變導(dǎo)致酶與底物更好地結(jié)合,形成一個互相契合的酶-底物復(fù)合物。
(3).結(jié)合能與過渡態(tài)理論:結(jié)合能來自酶與底物之間的非共價作用。結(jié)合能被用于降低活化能。酶與底物過渡態(tài)之間產(chǎn)生最多最適的非共價作用,釋放最多結(jié)合能。與酶經(jīng)誘導(dǎo)契合調(diào)整后的構(gòu)象最匹配的是底物經(jīng)形變產(chǎn)生的過渡態(tài),酶與底物過渡態(tài)的親和力要大于酶與底物或產(chǎn)物的親和力。過渡態(tài)理論的證明(如抗體酶、競爭性抑制劑)。
(4).酸堿催化:通過向反應(yīng)物提供質(zhì)子或從反應(yīng)物接受質(zhì)子以穩(wěn)定過渡態(tài),加速反應(yīng)的一類催化機(jī)制.
共價催化:催化劑通過與底物形成不穩(wěn)定的共價中間復(fù)合物,降低反應(yīng)活化能,從而提高反應(yīng)速度的機(jī)制。金屬離子催化:通過結(jié)合底物為反應(yīng)定向,電荷屏蔽與穩(wěn)定作用,在氧化還原反應(yīng)中起傳遞電子作用。
5.酶具有高催化效率的分子機(jī)理是:酶分子的活性部位結(jié)合底物形成酶-底物復(fù)合物,在酶的幫助作用下(包括共價作用與非共價作用),底物進(jìn)入特定的過渡態(tài),由于形成此類過渡態(tài)所需要的活化能遠(yuǎn)小于非酶促反應(yīng)所需要的活化能,因而反應(yīng)能夠快速、順利地進(jìn)行,形成產(chǎn)物并釋放出游離的酶,使其能夠參與其余底物的反應(yīng)。一種酶的催化作用常常是多種催化機(jī)制的綜合作用。酶的活性部位一般都含有多個與酶催化作用相關(guān)的基團(tuán),可以通過協(xié)同作用。
6.胰凝乳蛋白酶催化反應(yīng)機(jī)制:催化三聯(lián)體,共價催化+酸堿催化。
酶促反應(yīng)動力學(xué)
在酶催化的反應(yīng)中,酶先與底物形成酶-底物中間復(fù)合物。當(dāng)?shù)孜锓肿釉诿缸饔孟掳l(fā)生化學(xué)變化后,中間復(fù)合物再分解成產(chǎn)物和酶。
1.米氏常數(shù)Km的意義:米氏常數(shù)是反應(yīng)速度為最大值的一半時的底物濃度,大小只與酶的性質(zhì)有關(guān),與酶的濃度無關(guān);不同的酶具有不同Km值。Km值只是在固定的底物,一定的溫度和pH條件下,一定的緩沖體系中測定的,不同條件下具有不同的Km值。
1/Km值可用于近似地表示酶與底物之間的親和程度:1/Km值大表示親和程度大;1/Km值小表示親和程度小。Km值可用于計(jì)算酶促反應(yīng)初速率v,
在一定酶濃度下,Vmax是常數(shù);Vmax值只是在固定的底物,一定的溫度和pH條件下,一定的緩沖體系中測定的,不同條件下具有不同的Vmax值。
2.kcat的意義:kcat表示當(dāng)酶被底物飽和時每秒鐘每個酶分子轉(zhuǎn)換底物的分子數(shù),稱為轉(zhuǎn)換數(shù)(TN)或催化常數(shù)。kcat通常等于多步反應(yīng)中單一限度步驟的反應(yīng)速率常數(shù),例如kcat可等于經(jīng)典米氏動力學(xué)反應(yīng)過程的k3。kcat值越大,表示酶的催化效率越高。
生理?xiàng)l件下,[S]?Km時,kcat/Km的值可以作為酶促反應(yīng)速率大小的衡量。kcat/Km可用于綜合反映酶的催化能力。
3.影響酶促反應(yīng)速率的因素:
酶的抑制作用:改變酶的必需基團(tuán)的化學(xué)性質(zhì),引起酶活力降低或喪失的作用。
a.不可逆的抑制作用:抑制劑與酶的必需基團(tuán)通常以共價鍵結(jié)合,引起酶的永久性失活。
b.可逆的抑制作用:抑制劑與酶蛋白以非共價鍵結(jié)合,引起酶活性暫時性喪失。抑制劑可以通過透析、超濾等物理方法被除去,并且能部分或全部恢復(fù)酶的活性。分為:競爭性抑制、非競爭性抑制、反競爭性抑制。
酶的調(diào)控
1.方式:改變酶的數(shù)量與分布(同工酶),改變酶個體的活性(改變酶的結(jié)構(gòu)、直接干涉酶與底物的相互作用)。
2.通過改變酶結(jié)構(gòu)調(diào)控酶活性:別構(gòu)調(diào)控、可逆的共價修飾、酶原激活(蛋白激酶A的激活、表皮生長因子受體的激活)。
3.別構(gòu)調(diào)控:許多酶除具有活性部位外,還具有調(diào)節(jié)部位,酶的調(diào)節(jié)部位可以與某些化合物可逆地非共價結(jié)合,使酶發(fā)生構(gòu)象的改變,進(jìn)而改變酶的催化活性,這種酶活性的調(diào)節(jié)方式稱為酶的別構(gòu)調(diào)控。別構(gòu)調(diào)控可分為同促別構(gòu)調(diào)控與異促別構(gòu)調(diào)控,同促別構(gòu)調(diào)控中,酶的活性部位和調(diào)節(jié)部位是相同的,效應(yīng)物是底物;異促別構(gòu)調(diào)控中,酶的活性部位和調(diào)節(jié)部位是不同的,效應(yīng)物是非底物分子。
同促別構(gòu)調(diào)控:底物分子本身對別構(gòu)酶的調(diào)節(jié)作用。別構(gòu)酶底物濃度對反應(yīng)速率的動力學(xué)曲線不是雙曲線,是S形曲線。
異促別構(gòu)調(diào)控:非底物分子的調(diào)節(jié)物對別構(gòu)酶的調(diào)節(jié)作用。
4.酶別構(gòu)調(diào)控的一般機(jī)理:別構(gòu)酶的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)-寡聚酶結(jié)構(gòu)。酶的某個活性部位結(jié)合底物后,構(gòu)象改變的信息在酶分子中進(jìn)行傳遞,最終產(chǎn)生效應(yīng),影響酶的總活性狀態(tài)。多肽鏈之間的界面作為分子開關(guān)起關(guān)鍵作用。非底物效應(yīng)物通過與非活性部位(調(diào)節(jié)部位)結(jié)合,引起酶構(gòu)象的變化,最終影響酶的總活性狀態(tài)。
5.酶別構(gòu)調(diào)控的意義:在酶水平對代謝進(jìn)行調(diào)節(jié),反饋抑制。
6.可逆的共價修飾:由其它的酶對共價調(diào)節(jié)酶進(jìn)行可逆共價修飾,使其在活性形式和非活性形式之間相互轉(zhuǎn)變,從而調(diào)節(jié)酶活性。蛋白質(zhì)的磷酸化是一種重要的可逆的共價修飾形式,指由蛋白激酶催化的把ATP或GTP位磷酸基轉(zhuǎn)移到底物蛋白質(zhì)氨基酸殘基上的過程,其逆過程是由蛋白磷酸酶催化的水解反應(yīng),稱為蛋白質(zhì)的脫磷酸化。在信號傳遞體系中,通過各級蛋白激酶介導(dǎo)的激活反應(yīng),構(gòu)成了級聯(lián)式放大反應(yīng)的主體。
7.酶原的激活:在蛋白酶的專一作用下,酶原結(jié)構(gòu)發(fā)生改變,形成酶的活性部位,變成有活力的酶的活化過程。
酶原:在生物體內(nèi)被合成的,不具有催化活性的酶的前體。
8.許多酶的調(diào)控作用是各種調(diào)控作用的組合。
分類方式
人體和哺乳動物體內(nèi)含有至少5000種酶。它們或是溶解于細(xì)胞質(zhì)中,或是與各種膜結(jié)構(gòu)結(jié)合在一起,或是位于細(xì)胞內(nèi)其他結(jié)構(gòu)的特定位置上,只有在被需要時才被激活,這些酶統(tǒng)稱胞內(nèi)酶;另外,還有一些在細(xì)胞內(nèi)合成后再分泌至細(xì)胞外的酶──胞外酶。
按反應(yīng)性質(zhì)
根據(jù)酶所催化的反應(yīng)性質(zhì)的不同,將酶分成七大類:
氧化還原酶類(oxidoreductase)促進(jìn)底物進(jìn)行氧化還原反應(yīng)的酶類,是一類催化氧化還原反應(yīng)的酶,可分為氧化酶和還原酶兩類。
轉(zhuǎn)移酶類(transferases)催化底物之間進(jìn)行某些基團(tuán)(如乙;、甲基、氨基、磷酸基等)的轉(zhuǎn)移或交換的酶類。例如,甲基轉(zhuǎn)移酶、氨基轉(zhuǎn)移酶、乙酰轉(zhuǎn)移酶、轉(zhuǎn)硫酶、激酶和多聚酶等。
水解酶類(hydrolases )催化底物發(fā)生水解反應(yīng)的酶類。例如,淀粉酶、蛋白酶、脂肪酶、磷酸酶、糖苷酶等。
裂合酶類(lyases)催化從底物(非水解)移去一個基團(tuán)并留下雙鍵的反應(yīng)或其逆反應(yīng)的酶類。例如,脫水酶、脫羧酶、碳酸酐酶、醛縮酶、檸檬酸合酶等。許多裂合酶催化逆反應(yīng),使兩底物間形成新化學(xué)鍵并消除一個底物的雙鍵。合酶便屬于此類。
異構(gòu)酶類(isomerases)催化各種同分異構(gòu)體、幾何異構(gòu)體或光學(xué)異構(gòu)體之間相互轉(zhuǎn)化的酶類。例如,異構(gòu)酶、表構(gòu)酶、消旋酶等。
合成酶類(ligase)催化兩分子底物合成為一分子化合物,同時偶聯(lián)有ATP的磷酸鍵斷裂釋能的酶類。例如,谷氨酰胺合成酶、DNA連接酶、氨基酸:tRNA連接酶以及依賴生物素的羧化酶等。
易位酶類(translocase)催化離子或分子跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)或在膜內(nèi)移動的酶類。其中有些涉及ATP水解反應(yīng)的酶被歸為水解酶類(EC 3.6.3-),但水解反應(yīng)并非這類酶的主要功能。因此,命名委員會近期決定將這類酶歸為第七大類酶。
按照國際生化協(xié)會公布的酶的統(tǒng)一分類原則,在上述七大類基礎(chǔ)上,在每一大類酶中又根據(jù)底物中被作用的基團(tuán)或鍵的特點(diǎn),分為若干亞類;為了更精確地表明底物或反應(yīng)物的性質(zhì),每一個亞類再分為幾個組(亞亞類);每個組中直接包含若干個酶。
按化學(xué)組成
單純蛋白質(zhì)
屬于單純蛋白質(zhì)的酶類,除了蛋白質(zhì)外,不含其他物質(zhì),如脲酶、蛋白酶、淀粉酶、脂肪酶和核糖核酸酶等
綴合蛋白質(zhì)
屬于綴合蛋白質(zhì)的酶類,除了蛋白質(zhì)外,還要結(jié)合一些對熱穩(wěn)定的非蛋白質(zhì)小分子物質(zhì)或金屬離子,前者稱為脫輔酶,后者稱為輔因子,脫輔酶與輔因子結(jié)合后所形成的復(fù)合物稱為全酶,即全酶=脫輔酶+輔因子。
反應(yīng)特點(diǎn)
1 高效性:酶的催化效率比無機(jī)催化劑更高,使得反應(yīng)速率更快;
2專一性:一種酶只能催化一種或一類底物,如蛋白酶只能催化蛋白質(zhì)水解成多肽;
3 多樣性:酶的種類很多,迄今為止已發(fā)現(xiàn)約4000多種酶,在生物體中的酶遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于這個數(shù)量;
4 溫和性:是指酶所催化的化學(xué)反應(yīng)一般是在較溫和的條件下進(jìn)行的;
5 活性可調(diào)節(jié)性:包括抑制劑和激活劑調(diào)節(jié)、反饋抑制調(diào)節(jié)、共價修飾調(diào)節(jié)和變構(gòu)調(diào)節(jié)等;
6 易變性:大多數(shù)酶是蛋白質(zhì),因而會被高溫、強(qiáng)酸、強(qiáng)堿等破壞;
7 有些酶的催化性與輔助因子有關(guān);
8 改變化學(xué)反應(yīng)速率,本身幾乎不被消耗;
9 只催化已存在的化學(xué)反應(yīng);
10 能加快化學(xué)反應(yīng)的速度,但酶不能改變化學(xué)反應(yīng)的平衡點(diǎn),也就是說酶在促進(jìn)正向反應(yīng)的同時也以相同的比例促進(jìn)逆向的反應(yīng),所以酶的作用是縮短了到達(dá)平衡所需的時間,但平衡常數(shù)不變;
11 降低活化能,使化學(xué)反應(yīng)速率加快;
12 與無機(jī)催化劑一樣,也會出現(xiàn)中毒現(xiàn)象。
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